Przejdź do głównej treści

Widok zawartości stron Widok zawartości stron

Nawigacja okruszkowa Nawigacja okruszkowa

Widok zawartości stron Widok zawartości stron

 

Logo Uczelnia Badawcza Inicjatywa Doskonałości (IDUB)
 
Logo POB Bios w kolorach niebiesko-kolarowych
 

Widok zawartości stron Widok zawartości stron

Widok zawartości stron Widok zawartości stron

O POB BioS

Inicjatywa Doskonałości – Uczelnia Badawcza

Priorytetowy Obszar Badawczy BioS – biologia strukturalna i translacyjna jest jednym z siedmiu obszarów wyodrębnionych w Uniwersytecie Jagiellońskim w związku z wdrożeniem w życie programu IDUB (Inicjatywa Doskonałości – Uczelnia Badawcza). Pozostałe POB-y to:
  • Heritage – dziedzictwo kulturowe
  • FutureSoc – kompleksowe badania zmian społecznych wywołanych rozwojem nowoczesnych technologii i nauk kognitywnych
  • qLife – jakość badań dla jakości życia
  • SciMat – projektowanie zaawansowanych materiałów od modeli i narzędzi teoretycznych przez syntezę i analizę własności po aplikacje
  • DigiWorld – cyfrowy świat i cyberprzestrzeń
  • Anthropocene – przyczyny, przebieg i konsekwencje globalnych zmian środowiska.

Członkowie POB BioS

Wokół POB BioS skoncentrowanych jest pięć jednostek Uniwersytetu Jagiellońskiego:
  • Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii (WBBiB)
  • Wydział Biologii (WB)
  • Małopolskie Centrum Biotechnologii (MCB)
  • Jagiellońskie Centrum Rozwoju Leków (JCET) 
  • Narodowe Centrum Promieniowania Synchrotronowego „Solaris” (NCPS Solaris).

Domeny badawcze

Dotacja finansowa przyznana POB BioS i podejmowane przez członków POB BioS działania służyć mają osiągnięciu wysokiego, liczącego się w świecie, poziomu badań prowadzonych w obrębię wskazanych poniżej domen. 
 
1. BIOLOGIA STRUKTURALNA
 
Zakres domeny badawczej: Biologia strukturalna koncentruje się wokół badań mających na celu poznanie struktury przestrzennej cząsteczek organicznych i nieorganicznych istotnych w biologii oraz ich dynamiki i interakcji. Przedmiotem prowadzonych badań są także cząsteczki wytworzone przez człowieka z elementów podobnych do cząsteczek biologicznych. Z uwagi na rozmaitość i złożoność problemów badawczych istotne jest wykorzystanie różnorodnych technik pozwalających na uzyskanie informacji w wysokiej (na przykład mikroskopii cryo-EM) i niskiej rozdzielczości lub wnioskowania pośredniego, na podstawie wszelakich adekwatnych technik biologii, chemii, fizyki i nauk pokrewnych lub metod obliczeniowych. Techniki te wzajemnie się uzupełniają. Uzasadnione jest więc stosowanie podejścia hybrydowego, polegającego na wnioskowaniu o badanym układzie na podstawie wyników uzyskanych z użyciem kilku technik. 
 
Przykładowe tematy badań w obrębie domeny badawczej:
  • Kompleksowa analiza struktury przestrzennej i dynamiki układu biomakrocząsteczkowego z zastosowaniem metod obrazowania bezpośredniego, wnioskowania pośredniego z wykorzystaniem metod integracyjnych oraz metodologii obliczeniowej.
  • Analiza zależności pomiędzy strukturą i funkcją w makrocząsteczkowych układach biologicznych oraz oddziaływania makrocząsteczek z małymi cząsteczkami chemicznymi przy wykorzystaniu wysokorozdzielczego obrazowania oraz analizy kinetycznej, termodynamicznej i spektroskopowej.
  • Analiza struktury kompleksu małocząsteczkowego przy wykorzystaniu spektrometrii mas, immunoprecypitacji i immunodetekcji i inżynierii komórki oraz charakterystyka wysokorozdzielcza wybranych komponentów kompleksu.
2. BADANIA „OMICZNE” i BIOINFORMATYKA
 
Zakres domeny badawczej: Rozwój technologii w obszarze badań „omicznych” (takich jak: genomika, proteomika, transkryptomika, metabolomika, lipidomika) i bioinformatyki otwiera nowe możliwości dla szerokorozumianych biologów, zarówno w zakresie badań podstawowych, jaki i badań o potencjale aplikacyjnym. Jest też doskonałym przykładem synergii wynikającej z interdyscyplinarnej współpracy genetyków ze specjalistami w dziedzinie biologii obliczeniowej. Duże ilości danych (tzw. BigData) w połączeniu z metodami uczenia maszynowego, umożliwiają poznanie cech genotypowych i fenotypowych, co z kolei daje stwarza szanse na rozwój medycyny spersonalizowanej i poprawę jakości życia.
 
Przykładowe tematy badań w obrębie domeny badawczej:
  • Zastosowanie metaanaliz do badania interakcji molekuł. 
  • Podstawy zmienności i ewolucji cech fenotypowych. 
  • Zastosowanie analiz wysokoprzepustowych i celowanych w badaniach funkcji genów.
3. BIOLOGIA KOMÓRKOWA, SYSTEMOWA I TRANSLACYJNA
 
Zakres domeny badawczej: Badania na poziomie komórek roślinnych i zwierzęcych, obejmujące między innymi poznanie mechanizmów fizjologicznych, patologicznych i terapeutycznych. W szczególności zaś badania dotyczące procesów zachodzących w komórkach, interakcji komórka-komórka, oraz odpowiedzi komórki/organizmu na czynniki środowiskowe prowadzone z wykorzystaniem organizmów modelowych oraz badania w zakresie obrazowania chemicznego w tkankach i komórkach i biologii translacyjnej. 
 
Przykładowe tematy badań w obrębie domeny badawczej:
  • Badania mechanizmów fizjologicznych i patologicznych na poziomie molekularnym, biochemicznym, funkcjonalnym, w modelach in vitro, ex vivo oraz in vivo
  • Badania mechanizmów farmakoterapeutycznych które mogą przynieść nowe sposoby leczenia i prewencji chorób w modelach in vitroex vivo oraz in vivo.
  • Wykorzystanie wyników badań podstawowych w kierunku badań o potencjale aplikacyjnym.
4. BIOLOGIA EWOLUCYJNA I BADANIA BIORÓŻNORODNOŚCI 
 
Zakres domeny badawczej: Badania procesów ewolucyjnych oraz procesów kształtujących globalne i lokalne wzorce bioróżnorodności. Badania takie, poza ich znaczeniem poznawczym, stanowią podstawę dla opracowania strategii minimalizujących wpływ czynników pochodzenia antropogenicznego na bioróżnorodność i funkcjonowanie ekosystemów i całej biosfery.
 
Przykładowe tematy badań w obrębie domeny badawczej:
  • Funkcjonowanie ekosystemów w antropocenie. 
  • Wzorce bioróżnorodności. 
  • Stosowana biologia konserwatorska. 
5. BIOLOGIA KONFLIKTU I KOOPERACJI
 
Zakres domeny badawczej: Zrozumienie interakcji między organizmami w układach o różnych rodzajach oddziaływań, w szczególności antagonistycznych (np. patogen-gospodarz) i symbiotycznych (np. mikrobiom-gospodarz, mikoryzy). Badanie eksperymentalne i modelowanie teoretyczne mechanizmów infekcji, obrony i tolerancji oraz ich ewolucji. Konsekwencje (pato)fizjologiczne interakcji.
 
Przykładowe tematy badań w obrębie domeny badawczej:
  • Mechanizmy interakcji komórek prokariotycznych i eukariotycznych z patogenami i symbiontami.
  • Charakterystyka jednostek chorobowych i zmiany w ekspresji genów w odpowiedzi na stres wywołany przez patogeny lub symbionty.
  • Modelowanie koewolucji w układach antagonistycznych i symbiotycznych.